Kodladığım sitede İE'de linklere tıkladığım zaman çalışıyor fakat linkler arası geçiş yaparken ekran parlayıp sönüyor. Nedeni ne olabilir?

Ne demek istediğiniz, daha doğrusu ekranın parlayıp sönmesinden kastınız nedir tam olarak anlaşılamıyor. Buna rağmen benim görüşüm kodlara farkında olmadan bir Java eklemişsiniz. Çünkü genelde ekranla ilgili bu tarz görüntü hareketini yapabilecek kod büyük ihtimalle java kodudur.