Bilmek istediğin her şeye ulaş

NCBI veritabanlarında nasıl arama yapılır?


Site içinde arama yapılmasını kolaylaştıracak onlarca veri tabanı barındırır.NCBI ziyaret edildiğinde üst kısımda arama kutusu onun solunda ise veritabanı listesi yer alır.Veritabanları içerdikleri bilgilere göre incelenecek olursa,

-PUMBED : NCBI üzerinden en fazla arama yapılan kısımdır.Biyolojik sistemlere ait tüm etkileşimdeki makaleler burada toplanmıştır.Aynı zamanda yeni metotlarla ilgili makaleler de içerir.Yani incelediğinizi merak ettiğiniz bir biyolojik faktör hakkında daha önce yayınlanmış makalelei bulabilirsiniz.

-Protein : Özel bir protein hakkında bilgi almak için kullanılan veritabanıdır.

-Nucleotide : Özel bir genle ilgileniyorsa genin ya da bu gene ait tek bir ekzonun bir virüsün tüm genomunun vs, sekansını bulmak için kullanılır.

-EST : Genom üzerinde özel bir gen aranacaksa tüm geni aramak yerine sadce o gene ait EST'yi arayabilirsiniz.Yani EST veri tabanında şu ana kadar çıkarılmış EST'ler yer alır.

-GSS : EST'yle aynı mantıkta çalışırTek fark olarak mRNA üretmeyen bölgelere ait özel diziler de araştırılabilir.

Structure : Bir proteinin 3 boyutlu yapısını bulmak için kullanılır.

-Genome : Archaea, Bacteria, Eukaryotae, Virüsler, Viroidler ana gruplarına ait canlıların genonlarının genel olarak incelenmesine olanak verir.

-Biosystems :  Pathway adı altında toplanan tüm biyolojik etkileşimlerin bulunduğu veritabanı.

-Books : NCBI üzerinde bulunan kitaplar üzerinden arama yapar.

-CancerChromosomes : Temel olarak kanser vakalarının karyotip sonuçlarını barındırır.

-Conserved Domains : Proteinlerdeki özellikle korunmuş kısımları bir hiyerarşi biçimnde listeler.

-dbGaP : Genotip ve fenotip arasındaki bağıntıların sonuçlarını barındırır.

-dbVar : Yapısal genomik varyasonları içerir. 
  • Paylaş
Sonraki Soru
HESAP OLUŞTUR

İstatistikler

892 Görüntülenme3 Takipçi1 Yanıt