Stres tepkisi vücudun işleyişini tamamen etkiler. Kaçmak veya savaşmak için gerekli olmayan organlara kan ve dolayısıyla oksijen gönderimi azalır. Bu tepki uzun sürerse ve sık olursa söz konusu organlar (sindirim sistemi gibi) olumsuz etkilenecektir. Diğer taraftan kaslar, kalp ve savaşmak için hayati önem taşıyan organlar da sürekli olarak aşırı bir yoğunlukla çalışacaklarından stres onalrı da olumsuz etkiler. Vücudun zayıf olan yerleri ilk çöken yerler olur ve hastalıklar ilk olarak buralardan çıkar. Bu sebeple diyebiliriz ki direkt olarak sebebiyet vermese bile stres pek çok hastalığı tetikler. Daha sıklıkla ortaya çıkarttığı rahatsızlıklar zaten diğer cevaplarda belirtilmiş, ancak yukarda anlattığım sebeplerden dolayı liste bundan daha uzun olabilir. Örneğin kanser hastaları için moralin önemli olduğunun söylenmesinin sebebi de budur.